Egnatia ka marrë kalendarin e plotë për fazën e ligës së UEFA Conference League. Kampionët e Shqipërisë do të nisin këtë aventurë më 15 tetor 2026, në shtëpi ndaj danezëve të Midtjylland, takim i planifikuar për orën 18:45. Një javë më vonë, më 22 tetor, rrogozhinasit do të udhëtojnë në Danimarkë për të luajtur ndaj Aarhusit në orën 21:00.
Ndeshja e tretë e grupit është më 5 nëntor në Rumani, ku Egnatia do të përballet me Universitatea Craiova. Pas dy transfertave të para, skuadra e trajnerit Nevil Dedes do të ketë dy ndeshje radhazi në shtëpi: më 26 nëntor pritje ndaj Lincoln Red Imps të Gjibraltarit në orën 18:45 dhe më 10 dhjetor përballje me Kauno Žalgiris të Lituanisë në orën 21:00. Faza e ligës do të mbyllet më 17 dhjetor, me një transfertë të vështirë në Portugali kundër Bragës, takim që nis në orën 21:00.
Në total Egnatia do të luajë tre ndeshje në shtëpi dhe tri në transfertë, me ciklin që nis më 15 tetor dhe përfundon më 17 dhjetor. Për herë të parë në historinë e klubit, rrogozhinasit do të marrin pjesë në fazën e ligës së një kompeticioni europian; pjesëmarrja u sigurua pasi u eliminuan nga Lillestrom në play-off-in e Europa League dhe më pas kaluan në Conference League.
Kalendarin e detyron përballje me ekipe nga Danimarka, Rumania, Gjibraltari, Lituania dhe Portugalia. Dy ndeshjet në shtëpi shihen si të rëndësishme në përpjekjen për të grumbulluar pikë. Qëllimi i skuadrës është të marrë sa më shumë pikë për të synuar një vend midis 24 skuadrave që do të vazhdojnë në fazën e eliminimit direkt.
